Zwonienie czynności serca, ból w klatce piersiowej, zmiany obrazu krwi, senność, spowolnienie reakcji, ból i zawroty głowy, nadwrażliwość na światło, stany splątania i dezorientacji, ataksja (działania te występują najczęściej na początku leczenia, u osób w podeszłym wieku i z reguły ustępują w czasie trwania dalszej kuracji), zaburzenia widzenia (niewyraźne, podwójne widzenie, oczopląs), nudności, dolegliwości żołądkowe, uczucie suchości w jamie ustnej, niesmak, zatrzymanie moczu,mimowolne oddawanie moczu lub nietrzymanie moczu, pokrzywka, wypryski, wypadanie włosów, zaburzenia pigmentacji, osłabienie mięśni, drżenie mięśni, bóle mięśniowe, brak apetytu, obniżenie ciśnienia tętniczego kwi, osłabianie, omdlenia, u niemowląt i dzieci, w szczególności, gdy występują zaburzenia psychiczne, klonazepam może zwiększać ilość wydzieliny oskrzelowej i śliny (w takich przypadkach zalecane jest częste sprawdzanie drożności dróg oddechowych). Ponadto w miejscu podania dożylnego może dojść do zapalenia żyły, alergiczne reakcje skórne, zaburzenia czynności wątroby, zaburzenia miesiączkowania, zaburzenia libido, impotencja, reakcje paradoksalne (niepokój psychoruchowy, bezsenność, zwiększona pobudliwość i agresywność, nerwowość, wrogość, zaburzenia snu, koszmary, zaburzenia osobowości, drżenie mięśniowe, drgawki).
 
Lek upośledza sprawność psychomotoryczną.